DeepMind CEO 戴米斯·哈萨比斯介绍，AlphaFold 3是建模细胞中分子相互作用的第一步，可对蛋白质、DNA、RNA等大分子和小分子进行建模，揭示其结构和工作机制。谷歌DeepMind总监约翰·詹珀表示，这标志着模型的巨大飞跃，简化了不同原子共同工作的过程。
在工作机制层面，DeepMind通过改进扩散技术完善AlphaFold 3的底层模型架构。Isomorphic Labs将AlphaFold 3与内部人工智能模型结合，尝试识别抗逆作物、研发新疫苗，并与制药公司合作开发新的疾病治疗方法。
虽未发布完整代码，DeepMind提供名为AlphaFold Server的公共接口，限制可尝试的分子并仅用于非商业目的。哥伦比亚大学助理教授穆罕默德·库莱希认为，AlphaFold 3的发布是巨大飞跃，但也存在一些缺陷，目前主要用于宣传作用。采用开放式，鼓励读者思考或讨论。